Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP22Q9UPT9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP22Q9UPT9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP22Q9UPT9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms