Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC12A4Q9UP95 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC12A4Q9UP95 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC12A4Q9UP95 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.2 ms