Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNX4

WDR3, WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR3Q9UNX4 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.197e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-231ENST00000530306 583 ntTSL 216.13■□□□□ 0.177e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 516.06■□□□□ 0.167e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ADCY7-207ENST00000564965 578 ntTSL 416.05■□□□□ 0.167e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 MRPS28-209ENST00000522987 487 ntTSL 316.05■□□□□ 0.167e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PKN1-206ENST00000586237 529 ntTSL 516.04■□□□□ 0.167e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.167e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 515.98■□□□□ 0.157e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 REXO1-207ENST00000590936 1271 ntTSL 515.85■□□□□ 0.137e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.127e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.127e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.127e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.127e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ADCY7-206ENST00000564044 575 ntTSL 315.7■□□□□ 0.17e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.097e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ADCY7-213ENST00000568933 170 ntTSL 315.62■□□□□ 0.097e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-211ENST00000525261 559 ntTSL 215.58■□□□□ 0.087e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 415.58■□□□□ 0.087e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.077e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 215.48■□□□□ 0.077e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.077e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PKN1-213ENST00000591461 867 ntTSL 315.43■□□□□ 0.067e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.067e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 USP36-210ENST00000588086 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.38■□□□□ 0.057e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.047e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.037e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ABHD4-206ENST00000539344 986 ntTSL 215.19■□□□□ 0.027e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ABHD4-208ENST00000542041 465 ntTSL 415.19■□□□□ 0.027e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.017e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 FAM129B-204ENST00000468379 828 ntTSL 315.11■□□□□ 0.017e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 07e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.017e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-240ENST00000531770 589 ntTSL 415□□□□□ -0.017e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.017e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.027e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 IGF2BP3-206ENST00000468005 2948 ntTSL 514.84□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 FAM129B-206ENST00000478917 362 ntTSL 514.8□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 USP36-214ENST00000589225 5885 ntTSL 1 (best)14.8□□□□□ -0.047e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SPIDR-214ENST00000521550 1849 ntTSL 214.77□□□□□ -0.057e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.097e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 214.47□□□□□ -0.097e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.097e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 514.31□□□□□ -0.127e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 314.31□□□□□ -0.127e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 RTL10-205ENST00000484072 1385 ntTSL 214.21□□□□□ -0.147e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.147e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-233ENST00000530545 616 ntTSL 414.13□□□□□ -0.157e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 REXO1-204ENST00000587404 279 ntTSL 214.06□□□□□ -0.167e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 314.02□□□□□ -0.177e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.177e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.187e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.217e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 513.63□□□□□ -0.237e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SPIDR-217ENST00000522117 2745 ntTSL 213.61□□□□□ -0.237e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.237e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.247e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-220ENST00000528303 558 ntTSL 413.4□□□□□ -0.267e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEF1D-254ENST00000534475 538 ntTSL 413.18□□□□□ -0.37e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 WDR27-202ENST00000441385 683 ntTSL 313.1□□□□□ -0.317e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 GSE1-215ENST00000635906 666 ntTSL 313.01□□□□□ -0.337e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.337e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 MRPS28-202ENST00000518271 487 ntTSL 512.85□□□□□ -0.357e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)12.71□□□□□ -0.377e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.387e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.417e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 AKT2-213ENST00000452077 577 ntTSL 312.37□□□□□ -0.437e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SPIDR-212ENST00000519661 1035 ntTSL 212.19□□□□□ -0.467e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 PTBP2-205ENST00000460706 1129 ntTSL 212.03□□□□□ -0.487e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SAMD4B-206ENST00000596368 1176 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.537e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ABHD4-209ENST00000544562 929 ntTSL 211.62□□□□□ -0.557e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SACM1L-213ENST00000471207 534 ntTSL 311.57□□□□□ -0.567e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SPIDR-224ENST00000524126 2614 ntTSL 1 (best)11.51□□□□□ -0.577e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 KIF2A-201ENST00000381103 3360 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.577e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SAMD4B-213ENST00000610417 3664 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.597e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SAMD4B-214ENST00000611159 3662 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.597e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SPIDR-222ENST00000524006 970 ntTSL 511.36□□□□□ -0.597e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SPIDR-204ENST00000517824 849 ntTSL 511.36□□□□□ -0.597e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 511.34□□□□□ -0.597e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.597e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 MRPS28-208ENST00000521605 437 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.67e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ABHD4-202ENST00000418446 1003 ntTSL 211.31□□□□□ -0.67e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 AKT2-229ENST00000578123 564 ntTSL 411.3□□□□□ -0.67e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 CFLAR-202ENST00000340870 963 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.67e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 NDUFA10-206ENST00000419408 662 ntTSL 511.28□□□□□ -0.67e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 ABHD4-205ENST00000537243 550 ntTSL 511.17□□□□□ -0.627e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.657e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 SPIDR-225ENST00000524141 2761 ntTSL 210.88□□□□□ -0.677e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 WDR27-205ENST00000467418 947 ntTSL 510.81□□□□□ -0.687e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 CFLAR-215ENST00000457277 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.717e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.737e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 AKT2-202ENST00000358335 546 ntTSL 410.38□□□□□ -0.757e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 AKT2-241ENST00000596634 583 ntTSL 510.3□□□□□ -0.767e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 AKT2-209ENST00000423127 798 ntTSL 510.28□□□□□ -0.767e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 310.24□□□□□ -0.777e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 GRK2-209ENST00000530291 324 ntTSL 29.97□□□□□ -0.817e-6■■■■■ 27.7
WDR3Q9UNX4 KIF2A-204ENST00000504883 783 ntTSL 29.8□□□□□ -0.847e-6■■■■■ 27.7
Retrieved 100 of 1,750 protein–RNA pairs in 129 ms