Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CIZ1Q9ULV3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CIZ1Q9ULV3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CIZ1Q9ULV3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CIZ1Q9ULV3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CIZ1Q9ULV3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms