Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT8

HECTD1, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1, humanhuman

Predictions only

Length 2,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1Q9ULT8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HECTD1Q9ULT8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HECTD1Q9ULT8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HECTD1Q9ULT8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HECTD1Q9ULT8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD1Q9ULT8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms