Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
VAX2Q9UIW0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAX2Q9UIW0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAX2Q9UIW0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms