Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP25Q9UHP3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP25Q9UHP3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
USP25Q9UHP3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP25Q9UHP3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP25Q9UHP3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP25Q9UHP3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms