Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDKN2A-AS1Q9UH64 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN2A-AS1Q9UH64 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDKN2A-AS1Q9UH64 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms