Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
XCL2Q9UBD3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
XCL2Q9UBD3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
XCL2Q9UBD3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCL2Q9UBD3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.1 ms