Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC17A7Q9P2U7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC17A7Q9P2U7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC17A7Q9P2U7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC17A7Q9P2U7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC17A7Q9P2U7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A7Q9P2U7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A7Q9P2U7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A7Q9P2U7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A7Q9P2U7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A7Q9P2U7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A7Q9P2U7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC17A7Q9P2U7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC17A7Q9P2U7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms