Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RRBP1Q9P2E9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RRBP1Q9P2E9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RRBP1Q9P2E9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
RRBP1Q9P2E9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
RRBP1Q9P2E9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms