Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTGFRNQ9P2B2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGFRNQ9P2B2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGFRNQ9P2B2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms