Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLCO1C1Q9NYB5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLCO1C1Q9NYB5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms