Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPTLC3Q9NUV7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SPTLC3Q9NUV7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPTLC3Q9NUV7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPTLC3Q9NUV7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPTLC3Q9NUV7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms