Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf4Q9NR00 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf4Q9NR00 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C8orf4Q9NR00 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms