Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CBX8Q9HC52 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CBX8Q9HC52 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CBX8Q9HC52 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CBX8Q9HC52 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms