Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR41Q9HAD4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR41Q9HAD4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR41Q9HAD4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR41Q9HAD4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR41Q9HAD4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR41Q9HAD4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR41Q9HAD4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR41Q9HAD4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms