Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPF2Q9H7B2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPF2Q9H7B2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPF2Q9H7B2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPF2Q9H7B2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms