Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX17Q9H6I2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOX17Q9H6I2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX17Q9H6I2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SOX17Q9H6I2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.9 ms