Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRABDQ9H4I3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRABDQ9H4I3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRABDQ9H4I3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRABDQ9H4I3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRABDQ9H4I3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms