Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VCX3BQ9H321 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VCX3BQ9H321 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VCX3BQ9H321 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VCX3BQ9H321 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VCX3BQ9H321 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms