Protein–RNA interactions for Protein: Q9H305

CDIP1, Cell death-inducing p53-target protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIP1Q9H305 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDIP1Q9H305 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDIP1Q9H305 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDIP1Q9H305 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDIP1Q9H305 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDIP1Q9H305 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDIP1Q9H305 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDIP1Q9H305 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDIP1Q9H305 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDIP1Q9H305 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDIP1Q9H305 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDIP1Q9H305 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDIP1Q9H305 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDIP1Q9H305 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDIP1Q9H305 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDIP1Q9H305 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDIP1Q9H305 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDIP1Q9H305 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDIP1Q9H305 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDIP1Q9H305 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms