Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCOLN1Q9GZU1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCOLN1Q9GZU1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MCOLN1Q9GZU1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
MCOLN1Q9GZU1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MCOLN1Q9GZU1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms