Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
JAM3Q9BX67 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
JAM3Q9BX67 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
JAM3Q9BX67 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
JAM3Q9BX67 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms