Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHCHD5Q9BSY4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CHCHD5Q9BSY4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHCHD5Q9BSY4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHCHD5Q9BSY4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms