Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRACR2AQ9BSW2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRACR2AQ9BSW2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRACR2AQ9BSW2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CRACR2AQ9BSW2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRACR2AQ9BSW2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CRACR2AQ9BSW2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRACR2AQ9BSW2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRACR2AQ9BSW2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRACR2AQ9BSW2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRACR2AQ9BSW2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRACR2AQ9BSW2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRACR2AQ9BSW2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRACR2AQ9BSW2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRACR2AQ9BSW2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRACR2AQ9BSW2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CRACR2AQ9BSW2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms