Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.071e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 WDR74-212ENST00000541930 827 ntTSL 521.43■■□□□ 1.023e-10■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.971e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 MKNK2-204ENST00000586620 1135 ntTSL 220.96■□□□□ 0.954e-14■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-218ENST00000454786 1292 ntTSL 520.42■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.721e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)19.37■□□□□ 0.695e-16■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-216ENST00000445676 831 ntTSL 317.92■□□□□ 0.461e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-219ENST00000455999 760 ntTSL 517.8■□□□□ 0.441e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-214ENST00000440223 830 ntTSL 317.75■□□□□ 0.431e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-213ENST00000439780 571 ntTSL 511.77□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 SMAP2-205ENST00000539317 2501 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.555e-16■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 AK2-211ENST00000548559 530 ntTSL 411.54□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-208ENST00000433241 803 ntTSL 211.5□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.695e-16■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.85e-16■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 SEPT7-215ENST00000635047 760 ntTSL 48.51□□□□□ -1.054e-7■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.084e-14■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.124e-14■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.174e-14■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 FAM13A-217ENST00000511623 245 ntTSL 37.01□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 SEPT7-208ENST00000475109 733 ntTSL 56.72□□□□□ -1.334e-7■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 BZW1-201ENST00000359893 779 ntTSL 36.55□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.494e-14■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 BZW1-211ENST00000463310 582 ntTSL 25.26□□□□□ -1.572e-7■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.594e-14■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 SEPT7-213ENST00000634600 583 ntTSL 24.92□□□□□ -1.624e-7■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 PNPLA2-204ENST00000529255 1301 ntTSL 1 (best)19.52■□□□□ 0.727e-15■■■■■ 36.3
BUD13Q9BRD0 PNPLA2-203ENST00000526083 465 ntTSL 218.87■□□□□ 0.617e-15■■■■■ 36.3
BUD13Q9BRD0 HDAC3-213ENST00000492506 830 ntTSL 215.8■□□□□ 0.129e-10■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 TNS1-211ENST00000449814 582 ntTSL 38.06□□□□□ -1.121e-9■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 RNPEPL1-209ENST00000493398 1004 ntTSL 518.95■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 RNPEPL1-210ENST00000498042 344 ntTSL 218.13■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 RNPEPL1-206ENST00000471657 731 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 RNPEPL1-205ENST00000464550 812 ntTSL 515□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 ABCA13-201ENST00000411975 4480 ntTSL 212.86□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 RNPEPL1-204ENST00000460884 433 ntTSL 210.76□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 ABCA13-205ENST00000453246 4275 ntTSL 210.65□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 ABCA13-207ENST00000544596 7870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.72□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.552e-7■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 TOE1-204ENST00000477731 994 ntTSL 316.9■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 PSMD2-217ENST00000491149 895 ntTSL 211.11□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 PSMD2-209ENST00000460628 565 ntTSL 210.9□□□□□ -0.665e-7■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 KEAP1-206ENST00000590593 582 ntTSL 324.54■■□□□ 1.522e-7■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 KEAP1-210ENST00000592478 1044 ntTSL 1 (best)17.54■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 36.2
BUD13Q9BRD0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.075e-10■■■■■ 36
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BUD13Q9BRD0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.995e-10■■■■■ 36
BUD13Q9BRD0 GCAT-207ENST00000478203 551 ntTSL 220.42■□□□□ 0.865e-10■■■■■ 36
BUD13Q9BRD0 ARHGAP22-209ENST00000471013 690 ntTSL 320.22■□□□□ 0.835e-10■■■■■ 36
BUD13Q9BRD0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.85e-10■■■■■ 36
BUD13Q9BRD0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.675e-10■■■■■ 36
BUD13Q9BRD0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.655e-10■■■■■ 36
BUD13Q9BRD0 ARHGAP22-207ENST00000460425 2764 ntTSL 218.21■□□□□ 0.515e-10■■■■■ 36
BUD13Q9BRD0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.425e-10■■■■■ 36
BUD13Q9BRD0 ARHGAP22-215ENST00000515523 496 ntTSL 415.05■□□□□ -05e-10■■■■■ 36
BUD13Q9BRD0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.743e-8■■■■■ 35.9
BUD13Q9BRD0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.93e-8■■■■■ 35.9
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BUD13Q9BRD0 PPOX-212ENST00000495483 2471 ntTSL 221.15■□□□□ 0.981e-10■■■■■ 35.7
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BUD13Q9BRD0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.551e-10■■■■■ 35.7
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BUD13Q9BRD0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.281e-10■■■■■ 35.7
BUD13Q9BRD0 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21e-10■■■■■ 35.7
BUD13Q9BRD0 PPOX-217ENST00000539753 816 ntTSL 516.28■□□□□ 0.21e-10■■■■■ 35.7
BUD13Q9BRD0 TMEM8A-202ENST00000424078 844 ntTSL 315.68■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 35.6
BUD13Q9BRD0 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.118e-8■■■■■ 35.5
BUD13Q9BRD0 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 35.5
BUD13Q9BRD0 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.982e-8■■■■■ 35.5
BUD13Q9BRD0 LDHA-223ENST00000545215 1340 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 35.5
BUD13Q9BRD0 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.132e-8■■■■■ 35.5
BUD13Q9BRD0 LDHA-219ENST00000541097 582 ntTSL 37.84□□□□□ -1.152e-8■■■■■ 35.5
BUD13Q9BRD0 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 35.5
BUD13Q9BRD0 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 520.5■□□□□ 0.872e-8■■■■■ 35.4
BUD13Q9BRD0 GAPDH-206ENST00000466525 1720 ntTSL 516.44■□□□□ 0.222e-16■■■■■ 35.4
BUD13Q9BRD0 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-16■■■■■ 35.4
BUD13Q9BRD0 GAPDH-207ENST00000466588 1363 ntTSL 512.95□□□□□ -0.342e-16■■■■■ 35.4
BUD13Q9BRD0 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 415.13■□□□□ 0.018e-9■■■■■ 35.3
BUD13Q9BRD0 HNRNPK-206ENST00000457156 1283 ntTSL 521.11■□□□□ 0.971e-8■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.681e-8■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.281e-8■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.891e-8■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 HNRNPK-207ENST00000472778 822 ntTSL 37.02□□□□□ -1.291e-8■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 HNRNPK-203ENST00000376256 562 ntTSL 25.72□□□□□ -1.494e-9■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 C20orf24-205ENST00000491113 734 ntTSL 229.29■■■□□ 2.282e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 DVL1-207ENST00000633096 580 ntTSL 427.32■■□□□ 1.962e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.823e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 426.34■■□□□ 1.813e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 DVL1-208ENST00000634054 828 ntTSL 525.3■■□□□ 1.648e-10■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 NOCT-203ENST00000630479 1572 ntTSL 525.24■■□□□ 1.633e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.623e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.623e-7■■■■■ 35.2
BUD13Q9BRD0 NPM3-202ENST00000462391 481 ntTSL 324.45■■□□□ 1.51e-13■■■■■ 35.2
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