RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495483.5

PPOX-212, Transcript of protoporphyrinogen oxidase, humanhuman

TSL 2

Gene PPOX, Length 2,471 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPOX-212ENST00000495483 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.71■■■■■ 4.43
PPOX-212ENST00000495483 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.62■■■■□ 3.45
PPOX-212ENST00000495483 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.1■■■■□ 3.37
PPOX-212ENST00000495483 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.04■■■■□ 3.36
PPOX-212ENST00000495483 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
PPOX-212ENST00000495483 ABCC9O60706 1549 aa35.18■■■■□ 3.22
PPOX-212ENST00000495483 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.85■■■■□ 3.17
PPOX-212ENST00000495483 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
PPOX-212ENST00000495483 SCRIBQ14160 1630 aa34.46■■■■□ 3.11
PPOX-212ENST00000495483 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.18■■■■□ 3.06
PPOX-212ENST00000495483 NACADO15069 1562 aa34.15■■■■□ 3.06
PPOX-212ENST00000495483 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.87■■■■□ 3.01
PPOX-212ENST00000495483 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.55■■■□□ 2.96
PPOX-212ENST00000495483 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.55■■■□□ 2.96
PPOX-212ENST00000495483 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
PPOX-212ENST00000495483 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.4■■■□□ 2.94
PPOX-212ENST00000495483 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.26■■■□□ 2.92
PPOX-212ENST00000495483 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.19■■■□□ 2.9
PPOX-212ENST00000495483 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.07■■■□□ 2.88
PPOX-212ENST00000495483 WIZO95785 1651 aa33.03■■■□□ 2.88
PPOX-212ENST00000495483 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
PPOX-212ENST00000495483 HRCP23327 699 aa32.77■■■□□ 2.84
PPOX-212ENST00000495483 SMARCA4P51532 1647 aa32.74■■■□□ 2.83
PPOX-212ENST00000495483 TRIM41Q8WV44 630 aa32.36■■■□□ 2.77
PPOX-212ENST00000495483 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
PPOX-212ENST00000495483 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.35■■■□□ 2.77
PPOX-212ENST00000495483 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.32■■■□□ 2.76
PPOX-212ENST00000495483 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
PPOX-212ENST00000495483 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.21■■■□□ 2.75
PPOX-212ENST00000495483 SMARCA2P51531 1590 aa32.21■■■□□ 2.75
PPOX-212ENST00000495483 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.19■■■□□ 2.74
PPOX-212ENST00000495483 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
PPOX-212ENST00000495483 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
PPOX-212ENST00000495483 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.03■■■□□ 2.72
PPOX-212ENST00000495483 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.03■■■□□ 2.72
PPOX-212ENST00000495483 ABCC8Q09428 1581 aa31.99■■■□□ 2.71
PPOX-212ENST00000495483 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
PPOX-212ENST00000495483 NCAPD3P42695 1498 aa31.67■■■□□ 2.66
PPOX-212ENST00000495483 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
PPOX-212ENST00000495483 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.55■■■□□ 2.64
PPOX-212ENST00000495483 HMGXB3Q12766 1538 aa31.51■■■□□ 2.64
PPOX-212ENST00000495483 SOGA1O94964 1423 aa31.49■■■□□ 2.63
PPOX-212ENST00000495483 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.46■■■□□ 2.63
PPOX-212ENST00000495483 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.43■■■□□ 2.62
PPOX-212ENST00000495483 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.4■■■□□ 2.62
PPOX-212ENST00000495483 SYNJ1O43426 1573 aa31.38■■■□□ 2.61
PPOX-212ENST00000495483 CFTRP13569 1480 aa31.16■■■□□ 2.58
PPOX-212ENST00000495483 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.13■■■□□ 2.57
PPOX-212ENST00000495483 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
PPOX-212ENST00000495483 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.06■■■□□ 2.56
PPOX-212ENST00000495483 NESP48681 1621 aa31.05■■■□□ 2.56
PPOX-212ENST00000495483 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
PPOX-212ENST00000495483 CUX1P39880 1505 aa31.01■■■□□ 2.55
PPOX-212ENST00000495483 TOP2BQ02880 1626 aa30.96■■■□□ 2.55
PPOX-212ENST00000495483 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
PPOX-212ENST00000495483 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
PPOX-212ENST00000495483 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
PPOX-212ENST00000495483 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
PPOX-212ENST00000495483 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.82■■■□□ 2.52
PPOX-212ENST00000495483 EEA1Q15075 1411 aa30.81■■■□□ 2.52
PPOX-212ENST00000495483 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.78■■■□□ 2.52
PPOX-212ENST00000495483 CEP162Q5TB80 1403 aa30.75■■■□□ 2.51
PPOX-212ENST00000495483 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.72■■■□□ 2.51
PPOX-212ENST00000495483 GOLGA3Q08378 1498 aa30.7■■■□□ 2.51
PPOX-212ENST00000495483 PRDM2Q13029 1718 aa30.69■■■□□ 2.5
PPOX-212ENST00000495483 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.68■■■□□ 2.5
PPOX-212ENST00000495483 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.62■■■□□ 2.49
PPOX-212ENST00000495483 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.62■■■□□ 2.49
PPOX-212ENST00000495483 CUX2O14529 1486 aa30.57■■■□□ 2.48
PPOX-212ENST00000495483 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.55■■■□□ 2.48
PPOX-212ENST00000495483 KIF27Q86VH2 1401 aa30.54■■■□□ 2.48
PPOX-212ENST00000495483 KIF21BO75037 1637 aa30.51■■■□□ 2.48
PPOX-212ENST00000495483 TOPBP1Q92547 1522 aa30.45■■■□□ 2.47
PPOX-212ENST00000495483 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.44■■■□□ 2.46
PPOX-212ENST00000495483 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
PPOX-212ENST00000495483 PRXQ9BXM0 1461 aa30.41■■■□□ 2.46
PPOX-212ENST00000495483 CLIP1P30622 1438 aa30.4■■■□□ 2.46
PPOX-212ENST00000495483 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
PPOX-212ENST00000495483 MYT1Q01538 1121 aa30.38■■■□□ 2.45
PPOX-212ENST00000495483 IGF1RP08069 1367 aa30.38■■■□□ 2.45
PPOX-212ENST00000495483 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.36■■■□□ 2.45
PPOX-212ENST00000495483 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.36■■■□□ 2.45
PPOX-212ENST00000495483 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.35■■■□□ 2.45
PPOX-212ENST00000495483 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
PPOX-212ENST00000495483 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
PPOX-212ENST00000495483 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.22■■■□□ 2.43
PPOX-212ENST00000495483 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.18■■■□□ 2.42
PPOX-212ENST00000495483 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.13■■■□□ 2.41
PPOX-212ENST00000495483 NEUROD1Q13562 356 aa30.11■■■□□ 2.41
PPOX-212ENST00000495483 P3H3Q8IVL6 736 aa30.11■■■□□ 2.41
PPOX-212ENST00000495483 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.06■■■□□ 2.4
PPOX-212ENST00000495483 ARAP1Q96P48 1450 aa30.04■■■□□ 2.4
PPOX-212ENST00000495483 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.391e-7■■■■■ 28.1
PPOX-212ENST00000495483 APLP2Q06481 763 aa29.96■■■□□ 2.39
PPOX-212ENST00000495483 ERCC6Q03468 1493 aa29.96■■■□□ 2.39
PPOX-212ENST00000495483 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.96■■■□□ 2.39
PPOX-212ENST00000495483 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.96■■■□□ 2.39
PPOX-212ENST00000495483 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.94■■■□□ 2.38
PPOX-212ENST00000495483 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.93■■■□□ 2.38
PPOX-212ENST00000495483 WDR97A6NE52 1622 aa29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.2 ms