Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOXF2Q9BQY4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RHOXF2Q9BQY4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms