Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HINFPQ9BQA5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HINFPQ9BQA5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HINFPQ9BQA5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HINFPQ9BQA5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms