Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TREX2Q9BQ50 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TREX2Q9BQ50 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TREX2Q9BQ50 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TREX2Q9BQ50 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TREX2Q9BQ50 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms