Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH3GL2Q99962 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3GL2Q99962 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3GL2Q99962 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3GL2Q99962 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3GL2Q99962 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms