Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP2Q99959 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP2Q99959 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKP2Q99959 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP2Q99959 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms