Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTAGE1Q96RT6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTAGE1Q96RT6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTAGE1Q96RT6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CTAGE1Q96RT6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms