Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
LMTK3Q96Q04 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
LMTK3Q96Q04 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
LMTK3Q96Q04 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
LMTK3Q96Q04 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
LMTK3Q96Q04 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
LMTK3Q96Q04 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms