Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIC6Q96NY7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CLIC6Q96NY7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIC6Q96NY7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLIC6Q96NY7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLIC6Q96NY7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLIC6Q96NY7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIC6Q96NY7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIC6Q96NY7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIC6Q96NY7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms