Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT3

GUCD1, Protein GUCD1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GUCD1Q96NT3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GUCD1Q96NT3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GUCD1Q96NT3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GUCD1Q96NT3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GUCD1Q96NT3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms