Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUNDC3BQ96NL0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RUNDC3BQ96NL0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RUNDC3BQ96NL0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RUNDC3BQ96NL0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms