Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSNARE1Q96NA8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSNARE1Q96NA8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSNARE1Q96NA8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSNARE1Q96NA8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms