Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RNF145Q96MT1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF145Q96MT1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF145Q96MT1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms