Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC41A3Q96GZ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC41A3Q96GZ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC41A3Q96GZ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC41A3Q96GZ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms