Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNFT2Q96EX2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNFT2Q96EX2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNFT2Q96EX2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNFT2Q96EX2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms