Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB3CQ96E17 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB3CQ96E17 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB3CQ96E17 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms