Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERP27Q96DN0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERP27Q96DN0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERP27Q96DN0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERP27Q96DN0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERP27Q96DN0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERP27Q96DN0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERP27Q96DN0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERP27Q96DN0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERP27Q96DN0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERP27Q96DN0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERP27Q96DN0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms