Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB39BQ96DA2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB39BQ96DA2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB39BQ96DA2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms