Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC124Q96CT7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC124Q96CT7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC124Q96CT7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC124Q96CT7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC124Q96CT7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC124Q96CT7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC124Q96CT7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC124Q96CT7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC124Q96CT7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC124Q96CT7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC124Q96CT7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC124Q96CT7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC124Q96CT7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms