Protein–RNA interactions for Protein: Q96A23

CPNE4, Copine-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4Q96A23 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE4Q96A23 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPNE4Q96A23 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms