Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC38A4Q969I6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A4Q969I6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC38A4Q969I6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC38A4Q969I6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC38A4Q969I6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms