Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP7Q93009 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP7Q93009 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP7Q93009 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP7Q93009 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP7Q93009 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP7Q93009 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP7Q93009 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP7Q93009 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP7Q93009 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP7Q93009 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP7Q93009 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP7Q93009 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP7Q93009 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP7Q93009 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP7Q93009 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP7Q93009 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP7Q93009 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP7Q93009 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP7Q93009 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP7Q93009 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP7Q93009 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP7Q93009 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP7Q93009 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP7Q93009 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP7Q93009 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP7Q93009 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP7Q93009 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP7Q93009 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP7Q93009 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP7Q93009 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP7Q93009 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP7Q93009 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP7Q93009 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP7Q93009 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP7Q93009 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP7Q93009 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP7Q93009 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP7Q93009 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP7Q93009 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP7Q93009 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP7Q93009 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP7Q93009 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP7Q93009 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP7Q93009 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP7Q93009 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP7Q93009 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP7Q93009 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP7Q93009 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP7Q93009 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP7Q93009 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP7Q93009 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP7Q93009 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP7Q93009 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP7Q93009 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP7Q93009 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP7Q93009 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP7Q93009 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP7Q93009 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP7Q93009 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP7Q93009 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP7Q93009 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP7Q93009 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP7Q93009 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP7Q93009 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP7Q93009 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP7Q93009 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP7Q93009 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP7Q93009 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP7Q93009 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP7Q93009 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP7Q93009 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP7Q93009 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP7Q93009 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP7Q93009 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP7Q93009 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP7Q93009 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP7Q93009 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP7Q93009 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP7Q93009 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP7Q93009 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP7Q93009 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP7Q93009 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP7Q93009 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP7Q93009 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP7Q93009 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP7Q93009 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP7Q93009 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP7Q93009 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP7Q93009 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP7Q93009 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP7Q93009 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP7Q93009 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP7Q93009 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP7Q93009 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP7Q93009 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP7Q93009 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP7Q93009 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP7Q93009 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP7Q93009 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms