Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL3LQ92901 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL3LQ92901 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL3LQ92901 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL3LQ92901 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms